主角麻生勝，是望月博士研究所的研究員，同時也是望月博士的助手，但是他被望月所欺騙，成爲他研究的新生命體(neo生命體)的試驗品。望月在麻生勝的體內輸入蝗蟲的基因，可是最終還是被他逃走了，此時他完全不能接受自己的身體有如此突變，於是便逃往深山，並一直沉睡了數年……後因爲得到了望月的感應而甦醒，原來是望月製造的新生命體覺醒，並因處於嫉妒而捉拿望月的兒子——望月宏，但慶幸的是，ZO挺身而出救回宏，並肩負起保護宏和消滅新生命體的責任，但後來，ZO得知望月被新生命體改造和控制，爲了不被這些新生命體破壞地球，假面騎士ZO將會和他們展開激烈的戰鬥!